• 1. 四川大学华西医院骨科(成都 610041);
  • 2. 重庆市九龙坡区第二人民医院骨科(重庆 400050);
  • 3. 山东第一医科大学附属第二医院急诊科(山东泰安 271000);
  • 4. 山东大学附属济南市中心医院骨科(济南 250000);
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目的 通过高通量测序获取创伤性脊髓损伤(traumatic spinal cord injury,TSCI)后环状非编码 RNA(circular RNA,circRNA)与微小 RNA(microRNA,miRNA)表达谱,预测潜在 circRNA-miRNA 调控网络。方法 取 48 只雄性 C57BL/6 小鼠(体质量 18~22 g)随机均分为两组(n=24),TSCI 组采用 Allen’s 打击器械制备 TSCI 模型,假手术组(Sham 组)仅切开椎板不损伤脊髓。术后 3 d,两组取材行 HE 染色,观察脊髓组织结构;提取组织总 RNA 建库,高通量测序鉴定 circRNA 和 miRNA 差异表达谱,基因本体分析(gene ontology,GO)注释差异表达的 circRNA 宿主基因功能,筛选显著差异表达的 miRNA,通过 TargetScan 和 miRanda 预测 circRNA-miRNA 靶向结合,筛选关键 circRNA,构建潜在调控网络。结果 HE 染色示 Sham 组小鼠脊髓结构完整无破裂,TSCI 组脊髓结构有明显损伤破裂。测序共鉴定出 17 440 个 circRNA、1 228 个 miRNA。差异表达的 circRNA 宿主基因主要富集在细胞质,生物过程中差异基因主要富集在转录的正调控和蛋白磷酸化过程。差异表达最显著的 miRNA 为 mmu-miR-21-5p,筛选出可与其靶向结合的 circRNA6730,以 circRNA6730 为核心构建潜在 circRNA-miRNA 调控网络。结论 通过表达谱分析和功能注释分析,显著差异表达的 circRNA 和 miRNA 有潜在的临床标志物价值,以 circRNA6730 为核心包含 mmu-miR-21-5p 的靶向互作网络可能在 TSCI 的发生发展过程中起重要调控作用,有助于阐明 TSCI 的病理生理进程机制,为临床诊疗提供新思路。

引用本文: 王文朝, 王善玺, 张正东, 李军, 谢伟, 苏延林, 陈佳男, 刘雷. 创伤性脊髓损伤后环状非编码 RNA-微小 RNA 潜在调控网络信息挖掘. 中国修复重建外科杂志, 2020, 34(2): 213-219. doi: 10.7507/1002-1892.201905079 复制

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